MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halanaerobium praevalens DSM 2228 chromosome

Total Repeats: 56077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017455	GAA	2	6	344	349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798918
2	NC_017455	A	6	6	370	375	100 %	0 %	0 %	0 %	385798918
3	NC_017455	ACT	2	6	426	431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798918
4	NC_017455	AAT	2	6	462	467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798918
5	NC_017455	GAA	2	6	510	515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798918
6	NC_017455	ACTG	2	8	518	525	25 %	25 %	25 %	25 %	385798918
7	NC_017455	TTA	2	6	555	560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798918
8	NC_017455	CAAAAA	2	12	613	624	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385798918
9	NC_017455	A	7	7	620	626	100 %	0 %	0 %	0 %	385798918
10	NC_017455	AGA	2	6	635	640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798918
11	NC_017455	A	6	6	642	647	100 %	0 %	0 %	0 %	385798918
12	NC_017455	A	6	6	649	654	100 %	0 %	0 %	0 %	385798918
13	NC_017455	TGT	2	6	716	721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385798918
14	NC_017455	CT	3	6	793	798	0 %	50 %	0 %	50 %	385798918
15	NC_017455	TTAT	2	8	799	806	25 %	75 %	0 %	0 %	385798918
16	NC_017455	AC	3	6	828	833	50 %	0 %	0 %	50 %	385798918
17	NC_017455	A	6	6	863	868	100 %	0 %	0 %	0 %	385798918
18	NC_017455	GTT	2	6	885	890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385798918
19	NC_017455	TCT	2	6	897	902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385798918
20	NC_017455	AATT	3	12	919	930	50 %	50 %	0 %	0 %	385798918
21	NC_017455	TGA	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798918
22	NC_017455	AAAG	2	8	1020	1027	75 %	0 %	25 %	0 %	385798918
23	NC_017455	AAG	2	6	1033	1038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798918
24	NC_017455	TTA	2	6	1084	1089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798918
25	NC_017455	CCT	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385798918
26	NC_017455	AGA	2	6	1127	1132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798918
27	NC_017455	A	7	7	1214	1220	100 %	0 %	0 %	0 %	385798918
28	NC_017455	AGT	2	6	1253	1258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798918
29	NC_017455	TAA	2	6	1271	1276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798918
30	NC_017455	TTC	2	6	1331	1336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385798918
31	NC_017455	TAA	3	9	1394	1402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798918
32	NC_017455	A	6	6	1401	1406	100 %	0 %	0 %	0 %	385798918
33	NC_017455	A	7	7	1440	1446	100 %	0 %	0 %	0 %	385798918
34	NC_017455	CTG	2	6	1453	1458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798918
35	NC_017455	A	7	7	1491	1497	100 %	0 %	0 %	0 %	385798918
36	NC_017455	AACT	2	8	1549	1556	50 %	25 %	0 %	25 %	385798918
37	NC_017455	GGA	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385798918
38	NC_017455	ATA	2	6	1624	1629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798918
39	NC_017455	A	6	6	1639	1644	100 %	0 %	0 %	0 %	385798918
40	NC_017455	ATA	3	9	2114	2122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798919
41	NC_017455	CTGC	2	8	2206	2213	0 %	25 %	25 %	50 %	385798919
42	NC_017455	ATT	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798919
43	NC_017455	A	6	6	2252	2257	100 %	0 %	0 %	0 %	385798919
44	NC_017455	TAAA	2	8	2270	2277	75 %	25 %	0 %	0 %	385798919
45	NC_017455	TTTA	2	8	2313	2320	25 %	75 %	0 %	0 %	385798919
46	NC_017455	AGA	2	6	2367	2372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798919
47	NC_017455	AAG	2	6	2398	2403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798919
48	NC_017455	A	7	7	2418	2424	100 %	0 %	0 %	0 %	385798919
49	NC_017455	T	7	7	2475	2481	0 %	100 %	0 %	0 %	385798919
50	NC_017455	CTA	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798919
51	NC_017455	CAC	2	6	2546	2551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385798919
52	NC_017455	A	6	6	2570	2575	100 %	0 %	0 %	0 %	385798919
53	NC_017455	GTA	2	6	2594	2599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798919
54	NC_017455	AAT	2	6	2614	2619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798919
55	NC_017455	ATA	2	6	2657	2662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798919
56	NC_017455	TGA	2	6	2748	2753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798919
57	NC_017455	CAG	2	6	2771	2776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798919
58	NC_017455	CTT	2	6	2810	2815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385798919
59	NC_017455	AGA	2	6	2856	2861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798919
60	NC_017455	CTG	2	6	2882	2887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798919
61	NC_017455	GAA	2	6	2911	2916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798919
62	NC_017455	A	6	6	2945	2950	100 %	0 %	0 %	0 %	385798919
63	NC_017455	TTATT	2	10	2967	2976	20 %	80 %	0 %	0 %	385798919
64	NC_017455	GAA	2	6	3001	3006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798919
65	NC_017455	TAG	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798919
66	NC_017455	ATTT	2	8	3075	3082	25 %	75 %	0 %	0 %	385798919
67	NC_017455	AATAAA	2	12	3216	3227	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385798920
68	NC_017455	AATTA	2	10	3237	3246	60 %	40 %	0 %	0 %	385798920
69	NC_017455	GTG	2	6	3281	3286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385798920
70	NC_017455	CAGG	2	8	3307	3314	25 %	0 %	50 %	25 %	385798920
71	NC_017455	GAA	2	6	3353	3358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798920
72	NC_017455	A	6	6	3400	3405	100 %	0 %	0 %	0 %	385798920
73	NC_017455	AAGT	2	8	3410	3417	50 %	25 %	25 %	0 %	385798920
74	NC_017455	ATA	2	6	3423	3428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798920
75	NC_017455	T	7	7	3509	3515	0 %	100 %	0 %	0 %	385798921
76	NC_017455	T	6	6	3543	3548	0 %	100 %	0 %	0 %	385798921
77	NC_017455	ATTT	2	8	3556	3563	25 %	75 %	0 %	0 %	385798921
78	NC_017455	GCA	2	6	3587	3592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798921
79	NC_017455	GCA	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798921
80	NC_017455	AAAT	2	8	3624	3631	75 %	25 %	0 %	0 %	385798921
81	NC_017455	A	7	7	3692	3698	100 %	0 %	0 %	0 %	385798921
82	NC_017455	TAA	2	6	3699	3704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798921
83	NC_017455	AAG	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798921
84	NC_017455	AG	3	6	3823	3828	50 %	0 %	50 %	0 %	385798921
85	NC_017455	TTA	2	6	3861	3866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798921
86	NC_017455	ATC	2	6	3869	3874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798921
87	NC_017455	ATC	2	6	3890	3895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798921
88	NC_017455	AAC	2	6	3977	3982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385798921
89	NC_017455	CTA	2	6	3986	3991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798921
90	NC_017455	ATT	2	6	4003	4008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798921
91	NC_017455	TAAA	2	8	4028	4035	75 %	25 %	0 %	0 %	385798921
92	NC_017455	CTT	2	6	4109	4114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385798921
93	NC_017455	GAT	2	6	4234	4239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798921
94	NC_017455	ATA	2	6	4240	4245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798921
95	NC_017455	AATGA	2	10	4255	4264	60 %	20 %	20 %	0 %	385798921
96	NC_017455	CAG	2	6	4291	4296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798921
97	NC_017455	CTG	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798921
98	NC_017455	GAT	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798921
99	NC_017455	T	6	6	4385	4390	0 %	100 %	0 %	0 %	385798921
100	NC_017455	AAG	2	6	4407	4412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798921
101	NC_017455	ATTA	2	8	4419	4426	50 %	50 %	0 %	0 %	385798921
102	NC_017455	A	6	6	4522	4527	100 %	0 %	0 %	0 %	385798921
103	NC_017455	A	6	6	4536	4541	100 %	0 %	0 %	0 %	385798921
104	NC_017455	AGT	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798922
105	NC_017455	AG	3	6	4624	4629	50 %	0 %	50 %	0 %	385798922
106	NC_017455	TAC	2	6	4630	4635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798922
107	NC_017455	GAA	2	6	4652	4657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798922
108	NC_017455	GAA	2	6	4676	4681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798922
109	NC_017455	TTG	2	6	4689	4694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385798922
110	NC_017455	ATT	2	6	4695	4700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798922
111	NC_017455	G	6	6	4703	4708	0 %	0 %	100 %	0 %	385798922
112	NC_017455	GA	3	6	4734	4739	50 %	0 %	50 %	0 %	385798922
113	NC_017455	AGA	2	6	4798	4803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798922
114	NC_017455	CAT	2	6	4936	4941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798923
115	NC_017455	ATA	2	6	4961	4966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798923
116	NC_017455	TGA	2	6	4971	4976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798923
117	NC_017455	GAT	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798923
118	NC_017455	TGG	2	6	5139	5144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385798923
119	NC_017455	GTA	2	6	5191	5196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798923
120	NC_017455	TGGA	2	8	5212	5219	25 %	25 %	50 %	0 %	385798923
121	NC_017455	TA	3	6	5249	5254	50 %	50 %	0 %	0 %	385798923
122	NC_017455	GATTTT	2	12	5374	5385	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385798923
123	NC_017455	T	6	6	5418	5423	0 %	100 %	0 %	0 %	385798923
124	NC_017455	TATAAA	2	12	5433	5444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798923
125	NC_017455	TAG	2	6	5447	5452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798923
126	NC_017455	ATA	2	6	5453	5458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798923
127	NC_017455	AGA	2	6	5463	5468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798923
128	NC_017455	AAG	2	6	5477	5482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798923
129	NC_017455	TTG	2	6	5513	5518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385798923
130	NC_017455	A	6	6	5536	5541	100 %	0 %	0 %	0 %	385798923
131	NC_017455	AGA	2	6	5580	5585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798923
132	NC_017455	TAT	2	6	5604	5609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798923
133	NC_017455	ATC	2	6	5612	5617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798923
134	NC_017455	TAA	2	6	5649	5654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798923
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136	NC_017455	CTA	2	6	5702	5707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798923
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